Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms