Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP2C1P98194 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms