Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB1P82279 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB1P82279 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms