Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX1P78337 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX1P78337 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms