Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPNP63162 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms