Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms