Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBE2NP61088 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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