Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTPAP49638 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTPAP49638 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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