Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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CASQ1P31415 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASQ1P31415 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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