Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC9P31274 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC9P31274 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms