Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA1P29973 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA1P29973 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms