Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMA3P25788 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms