Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPREP23469 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPREP23469 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPREP23469 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPREP23469 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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