Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRDP23468 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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