Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP2C9P11712 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms