Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GLI4P10075 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GLI4P10075 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI4P10075 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms