Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms