Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms