Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms