Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM6AO15550 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM6AO15550 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM6AO15550 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms