Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APAF1O14727 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms