Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPH3AQ9Y2J0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms