Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms