Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms