Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms