Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC180Q9P1Z9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms