Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMG20BQ9P0W2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms