Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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