Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC24A3Q9HC58 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC24A3Q9HC58 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms