Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms