Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC41A2Q96JW4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms