Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms