Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms