Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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