Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA4DQ92854 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4DQ92854 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms