Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SELENOMQ8WWX9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms