Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN19Q8N6F1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms