Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTBP4Q8N2S1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBP4Q8N2S1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms