Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARMIL2Q6F5E8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms