Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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