Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC92Q53HC0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms