Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A12Q504Y0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms