Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETM2Q2VYF4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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