Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms