Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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LAMA3Q16787 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA3Q16787 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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