Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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