Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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