Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC85BQ15834 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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