Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA2Q15822 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms