Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EEA1Q15075 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EEA1Q15075 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms